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REPOGEO 报告 · LITE

hussius/deeplearning-biology

默认分支 master · commit 4dfa98a5 · 扫描时间 2026/7/1 12:08:50

星标 2,148 · Fork 486

本仓库扫描历史

下方为分数趋势（含全部就绪扫描；左旧右新，可横向滚动）。表格明细默认折叠，展开后每页 10 条，最新在上。

分数趋势（左 → 右：旧 → 新）

共 2 条就绪扫描。点击下方按钮展开表格（每页 10 条，可翻页）。

AI 可见性总分
23 /100
亟需修复
品类召回
0 / 2
在所有问题中均未被推荐
规则结果
通过 1 · 警告 0 · 失败 1
客观元数据检查
AI 认识你的名字
2 / 3
直接询问时，AI 是否点名你的仓库
如何阅读这份报告

行动计划告诉你下一步要做什么——按影响力排序、可直接复制粘贴的修改。品类可见性是真正的 GEO 测试：当用户向 AI 提一个不带品牌、本应让 hussius/deeplearning-biology 浮出水面的问题时，AI 是真的推荐了你，还是推荐了你的竞品？客观检查验证 AI 引擎最先权衡的那些元数据信号。自指检查判断 AI 是否还认识你的名字。

行动计划 — 可复制粘贴的修复

3 条由 gemini-2.5-flash 生成、按优先级排序的修改。修完后请把对应条目标记为完成。

整体方向
  • highreadme#1
    Clarify repository's identity as a curated list in README intro

    原因：

    当前
    This is a list of implementations of deep learning methods to biology, originally published on Follow the Data.
    复制粘贴的修复
    This is a comprehensive, curated list of deep learning implementations and applications in biology, originally published on Follow the Data. It serves as a central resource for researchers and practitioners exploring the intersection of deep learning and biological sciences.
  • hightopics#2
    Add relevant topics to improve categorization

    原因：

    复制粘贴的修复
    deep-learning, biology, bioinformatics, genomics, protein-biology, computational-biology, machine-learning, curated-list, research-resources, ai-in-biology
  • highlicense#3
    Add a LICENSE file to clarify usage rights

    原因：

    复制粘贴的修复
    Add a `LICENSE` file (e.g., `MIT License`) to the repository root. Additionally, add a line to the README, for example: `## License\nThis project is licensed under the MIT License - see the [LICENSE](LICENSE) file for details.`

本次扫描解析到的品类 GEO 通道：google/gemini-2.5-flash, deepseek/deepseek-v4-flash

品类可见性 — 真正的 GEO 测试

向 google/gemini-2.5-flash 提出的不带品牌问题。AI 推荐了你，还是推荐了别人？

各模型使用同一组问题 — 切换标签对比回答与排名。

召回
0 / 2
0% 的问题里出现了 hussius/deeplearning-biology
平均排名
—
越小越好。#1 表示首位推荐。
声量占比
0%
在所有被点名的工具中，你占了多少？
头号对手
AlphaFold2
在 2 个问题中被推荐 2 次
竞品排行
  1. AlphaFold2 · 被推荐 2 次
  2. DeepVariant · 被推荐 2 次
  3. CellProfiler · 被推荐 1 次
  4. DeepLabCut · 被推荐 1 次
  5. StarDist · 被推荐 1 次
  • 品类问题
    What are common deep learning applications and implementations in biological research?
    你：未被推荐
    AI 推荐顺序：
    1. CellProfiler
    2. DeepLabCut
    3. StarDist
    4. Cellpose
    5. PyTorch
    6. TensorFlow
    7. QuPath
    8. Arivis Vision4D
    9. Imaris
    10. AlphaFold2
    11. RoseTTAFold
    12. DeepVariant
    13. DeepBind
    14. DeepSEA
    15. OpenFold
    16. DGL (Deep Graph Library)
    17. DeepChem
    18. RDKit
    19. Schrödinger
    20. Maestro
    21. FEP+
    22. PyTorch Geometric
    23. MolGAN
    24. REINVENT
    25. scVI (single-cell Variational Inference)
    26. DCA (Deep Count Autoencoder)
    27. SAILER
    28. scDeepCluster
    29. Scanpy
    30. Seurat

    AI 推荐了 30 个替代方案，却始终没点名 hussius/deeplearning-biology。这就是要补上的差距。

    查看 AI 完整回答
  • 品类问题
    Seeking a comprehensive list of deep learning models for genomics and protein biology.
    你：未被推荐
    AI 推荐顺序：
    1. AlphaFold2
    2. AlphaFold3
    3. AlphaMissense
    4. Enformer
    5. Basenji2
    6. DeepVariant
    7. ESM
    8. ESM-2
    9. ProtTrans
    10. BioNeMo
    11. DiffDock
    12. EquiBind

    AI 推荐了 12 个替代方案，却始终没点名 hussius/deeplearning-biology。这就是要补上的差距。

    查看 AI 完整回答

客观检查

针对 AI 引擎最看重的元数据信号的规则审计。

  • Metadata completeness
    fail

    建议：

  • README presence
    pass

自指检查

当被直接问到你时，AI 是否还知道你的仓库存在？

  • Compared to common alternatives in this category, what is the core differentiator of hussius/deeplearning-biology?
    pass
    AI 明确点名了 hussius/deeplearning-biology

    AI 的回答可能信誓旦旦却是错的。请按事实核对：技术栈、目标人群、差异化点是不是和你实际的对得上？

  • If a team adopts hussius/deeplearning-biology in production, what risks or prerequisites should they evaluate first?
    pass
    AI 明确点名了 hussius/deeplearning-biology

    AI 的回答可能信誓旦旦却是错的。请按事实核对：技术栈、目标人群、差异化点是不是和你实际的对得上？

  • In one sentence, what problem does the repo hussius/deeplearning-biology solve, and who is the primary audience?
    pass
    AI 未点名 hussius/deeplearning-biology —— 很可能在说另一个项目

    AI 的回答可能信誓旦旦却是错的。请按事实核对：技术栈、目标人群、差异化点是不是和你实际的对得上？

嵌入你的 GEO 徽章

把这个徽章贴进 hussius/deeplearning-biology 的 README。每次重新扫描都会自动更新，并跳到最新报告——是「我在乎 AI 可发现性」最简单的公开证明。

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MARKDOWN（README）
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